A reacção global para a decomposição do glicogénio em glucose-1-fosfato é:
glicogénio(n resíduos) + Pi ⇌ glicogénio(n-1 resíduos) + glucose-1-fosfato
Aqui, a fosforilase glicogénica cliva a ligação ligando um resíduo de glicose terminal a um ramo de glicogénio através da substituição de um grupo fosforilo pela ligação α.
Glucose-1-fosfato é convertido em glucose-6-fosfato (que frequentemente acaba em glicólise) pela enzima fosfoglucomutase.
Resíduos de glicose são fosforolizados a partir de ramos de glicogénio até quatro resíduos antes de uma glicose que é ramificada com uma ligação a α. A enzima de resíduos de glicogénio transfere então três das quatro unidades de glicose restantes para o fim de outro ramo de glicogénio. Isto expõe o ponto de ramificação α, que é hidrolisado por α glucosidase, removendo o resíduo final de glicose do ramo como uma molécula de glicose e eliminando o ramo. Este é o único caso em que um metabolito de glicogénio não é glucose-1-fosfato. A glicose é subsequentemente fosforilada a glucose-6-fosfato por hexoquinase.