A maioria dos peixes de aquário de água doce saem-se bem em água macia a moderadamente dura, e que tem um pH entre 6 e 8,
Aquários de água de rocha são um caso especial e precisam de aquários comunitários dedicados. Enquanto alguns poucos peixes de água doce e marinha se podem adaptar à água salobra, a maioria não pode.
O químico mais mortal na água de aquário é o amoníaco, produzido a partir de excreções de peixes. É importante testar o amoníaco, uma vez que é um precursor químico de nitritos e nitratos, também prejudicial para os peixes. O amoníaco é removido da água através do ciclo do azoto, que tem lugar dentro do filtro do aquário, o qual leva algumas semanas para começar a processar o amoníaco. O amoníaco processado é convertido em nitrito, que é depois processado em nitrato. As mudanças semanais de água (25% do volume do aquário), ao aspirar os detritos do fundo do aquário, podem resolver este problema de acumulação de nitratos, desde que o aquário não esteja sobrelotado.
Build-up de algas está em grande parte relacionado com o nível de luz e desequilíbrio mineral. Um aquário perto de uma janela é susceptível de estar sobrelotado com algas. Um material conhecido como “esponja de fosfato” está disponível nas lojas de aquários para lixiviar o fosfato para fora do aquário e reduzir o crescimento de algas. Além disso, plantas como o musgo java (não o feto java) competem com as algas por outro nutriente vegetal necessário, nitrato, e reduzem o crescimento das algas. O musgo de Java também forma uma cobertura do solo ao longo do fundo do aquário.