Morris opuścił Anglię i dołączył do ojca w Marylandzie w 1747 roku, a następnie rozpoczął pracę w domu kupieckim w Filadelfii. W czasie wojny Morris był wiceprezesem Pensylwańskiego Komitetu Bezpieczeństwa (1775-76) i członkiem Kongresu Kontynentalnego (1775-78) oraz legislatury Pensylwanii (1778-79, 1780-81, 1785-86). Ponieważ miał nadzieję na pojednanie z Wielką Brytanią, nie podpisał Deklaracji Niepodległości aż do kilku tygodni po jej przyjęciu.
Jako przewodniczący lub członek różnych komisji Kongresu Kontynentalnego, Morris praktycznie kontrolował finansowe operacje wojenne w latach 1776-1778. Zgromadził fundusze, które umożliwiły gen. George’owi Washingtonowi przeniesienie armii z okolic Nowego Jorku do Yorktown, gdzie poddał się Lord Cornwallis (1781). Morris pożyczył od Francuzów, zarekwirował od stanów, a także wyłożył pieniądze z własnej kieszeni. W tym samym roku Morris założył w Filadelfii Bank of North America. Po wojnie służył jako superintendent finansów w ramach Artykułów Konfederacji (1781-84), a następnie jako członek zgromadzenia stanowego Pensylwanii. Był delegatem na Konwencję Konstytucyjną (1787) i zasiadał w Senacie Stanów Zjednoczonych (1789-95). W międzyczasie pozbył się swoich inwestycji kupieckich i bankowych i mocno zaangażował się w spekulacje ziemią. Kiedy zyski z jego ziemi zwolniły, zbankrutował i został zamknięty w więzieniu dla dłużników na ponad trzy lata przed uwolnieniem w 1801 roku.