W 1983 roku Kennedy był asystentem prokuratora okręgowego na Manhattanie. W 1984 r. Kennedy dołączył do Riverkeeper jako śledczy, a po przyjęciu do nowojorskiej palestry w 1985 r. został awansowany na starszego prokuratora.
Kennedy jest specjalistą w dziedzinie prawa ochrony środowiska i partnerem w kancelariach Morgan & Morgan PA i Kennedy & Madonna, LLP, i jest orędownikiem sprawiedliwości środowiskowej.
Poprzez spory sądowe, lobbing, nauczanie oraz kampanie publiczne i aktywizm, Kennedy opowiedział się za ochroną dróg wodnych, prawami tubylców i energią odnawialną.
W 2018 roku National Trial Lawyers Association przyznało Kennedy’emu i jego zespołowi procesowemu tytuł Trial Team of the Year za pracę wygrania 289 milionów dolarów werdyktu ławy przysięgłych w sprawie Dewayne „Lee” Johnson przeciwko Monsanto.
Riverkeeper
Kennedy prowadził i nadzorował sprawy sądowe związane z egzekwowaniem przepisów środowiskowych w ujściach rzek na wschodnim wybrzeżu w imieniu Hudson Riverkeeper i Long Island Soundkeeper, gdzie był również członkiem zarządu. Long Island Soundkeeper wniósł liczne pozwy przeciwko miastom i przemysłowi wzdłuż wybrzeża Connecticut i Nowego Jorku. W 1986 r. Kennedy wygrał przełomową sprawę przeciwko Remington Arms Trap and Skeet Gun Club w Stratford, Connecticut, która zakończyła praktykę strzelania ołowianym śrutem do Long Island Sound. Kennedy złożył również pozew federalny o zamknięcie wysypiska śmieci w Pelham Bay i klubów New York Athletic, argumentując, że obiekty te przeszkadzały w publicznym korzystaniu z Long Island Sound. W sprawie Hudson, Kennedy wytoczył serię procesów przeciwko gminom, w tym miastu Nowy Jork, o prawidłowe oczyszczanie ścieków, oraz przeciwko przemysłowi, w tym Consolidated Edison, General Electric i Exxon, o zaprzestanie zrzutów zanieczyszczeń i uprzątnięcie pozostałości po skażeniu.
W 1995 roku Kennedy opowiedział się za uchyleniem antyśrodowiskowych przepisów podczas 104 Kongresu. W 1997 r. Kennedy współpracował z Johnem Croninem przy pisaniu książki „The Riverkeepers”, historii wczesnych członków Riverkeepers i elementarza ruchu Waterkeeper.
W oparciu o swoje doświadczenie w prowadzeniu dochodzeń i ściganiu trucicieli w imieniu Waterkeepers, Kennedy napisał wiele o egzekwowaniu prawa w zakresie ochrony środowiska.
Pace Environmental Litigation Clinic
W 1987 roku Kennedy założył Environmental Litigation Clinic w Pace University School of Law, gdzie przez trzy dekady był nadzorującym prawnikiem i współdyrektorem kliniki, a także profesorem klinicznym prawa. Kennedy uzyskał specjalny nakaz od Sądu Apelacyjnego Stanu Nowy Jork, który zezwalał 10 studentom kliniki – studentom drugiego i trzeciego roku prawa – na praktykowanie prawa i prowadzenie spraw przeciwko zanieczyszczającym rzekę Hudson w sądach stanowych i federalnych, pod nadzorem Kennedy’ego i jego współdyrektora, profesora Karla Coplana. Pełnoetatowymi klientami kliniki są Riverkeeper i Long Island Soundkeeper.
Klinika oskarżyła wiele rządów i firm o zanieczyszczanie Long Island Sound oraz rzeki Hudson i jej dopływów. Klinika argumentowała sprawy o rozszerzenie dostępu obywateli do linii brzegowej i wygrała setki ugód dla Hudson Riverkeeper. Kennedy i jego studenci pozwali również dziesiątki miejskich oczyszczalni ścieków, aby wymusić zgodność z ustawą Clean Water Act. W 2010 roku, pozew Pace zmusił ExxonMobil do oczyszczenia dziesiątków milionów galonów ropy naftowej ze starych wycieków rafinerii w Newtown Creek w Brooklynie, Nowy Jork.
11 kwietnia 2001 roku, Men’s Journal uznał Kennedy’ego swoją nagrodą „Heroes” za stworzenie Pace Environmental Litigation Clinic. Kennedy i jego Pace Environmental Litigation Clinic otrzymali inne nagrody za udaną pracę prawną w zakresie oczyszczania środowiska. Klinika Pace stała się modelem dla podobnych klinik prawa środowiskowego w całym kraju, w tym Rutgers, Golden Gate, UCLA, Widener i Boalt Hall w Berkeley.
Waterkeepers Alliance
W czerwcu 1999 roku, kiedy sukces Riverkeeper na Hudson zaczął inspirować tworzenie Waterkeepers w całej Ameryce Północnej, Kennedy i kilkudziesięciu Riverkeepers zebrali się w Southampton, Long Island, aby założyć Waterkeeper Alliance, który jest obecnie grupą parasolową dla 344 licencjonowanych programów Waterkeeper w 44 krajach. Jako prezydent Sojuszu, Kennedy nadzoruje jego działalność prawną, członkowską, polityczną i programy fundraisingowe. Sojusz twierdzi, że jego celem jest promowanie „zdatnych do pływania, ryb i picia dróg wodnych na całym świecie”, a także jest izbą rozrachunkową, zatwierdzającą nowe programy strażników i udzielającą licencji na używanie znaków towarowych „Waterkeeper”, „Riverkeeper”, „Soundkeeper”, „Lakekeeper”, „Baykeeper”, „Bayoukeeper”, „Canalkalkeeper”, „Coastkeeper” itp. names.
Kennedy i jego praca na rzecz środowiska były przedmiotem kilku filmów, w tym The Hudson Riverkeepers (1998) i The Waterkeepers (2000), oba w reżyserii Lesa Guthmana. W 2008 r. wystąpił w filmie dokumentalnym IMAX Grand Canyon Adventure: River at Risk, płynąc drewnianym dory z córką Kick i antropologiem Wade’em Davisem wzdłuż Wielkiego Kanionu.
Umowa o zlewni Nowego Jorku
Począwszy od 1991 roku Kennedy reprezentował ekologów i konsumentów zlewni Nowego Jorku w serii pozwów przeciwko miastu Nowy Jork, stanowi Nowy Jork i zanieczyszczającym zlewnię. Kennedy był autorem serii artykułów i raportów, w których zarzucał, że stan Nowy Jork uchyla się od odpowiedzialności za ochronę zasobów i dostaw wody. W 1996 roku pomógł zaaranżować warte 1,2 miliarda dolarów porozumienie w sprawie działu wodnego Nowego Jorku, które magazyn New York opisał na okładce „The Kennedy Who Matters”. Umowa ta, którą Kennedy wynegocjował w imieniu ekologów i konsumentów zlewni Nowego Jorku, jest uważana za międzynarodowy model negocjacji konsensusu zainteresowanych stron i zrównoważonego rozwoju.
Kennedy & Madonna LLP
W 2000 r, Kennedy i prawnik specjalizujący się w ochronie środowiska Kevin Madonna założyli firmę prawniczą Kennedy & Madonna, LLP, aby reprezentować prywatnych powodów przeciwko zanieczyszczającym. Firma prowadzi sprawy sądowe dotyczące zanieczyszczenia środowiska w imieniu osób prywatnych, organizacji non-profit, okręgów szkolnych, publicznych dostawców wody, plemion indiańskich, gmin i stanów. W 2001 roku, Kennedy & Madonna zorganizowała zespół prestiżowych kancelarii powodowych, aby rzucić wyzwanie zanieczyszczeniom pochodzącym z przemysłowej produkcji wieprzowiny i drobiu. W 2004 r. firma była częścią zespołu prawnego, który zapewnił 70 milionów dolarów ugody dla właścicieli nieruchomości w Pensacola na Florydzie, których nieruchomości zostały skażone chemikaliami z przyległego terenu Superfund.
Kennedy & Madonna jest przedstawiona w filmie dokumentalnym HBO z 2010 r. Mann v. Ford, który jest kroniką czteroletniego procesu sądowego prowadzonego przez kancelarię w imieniu plemienia Indian Ramapough Mountain przeciwko Ford Motor Company w związku z wyrzuceniem toksycznych odpadów na ziemie plemienne w północnym New Jersey. Poza pieniężną ugodą dla plemienia, pozew przyczynił się do ponownego umieszczenia terenów należących do społeczności na federalnej liście Superfund, co było pierwszym przypadkiem w historii kraju, kiedy usunięte z listy miejsce zostało na nią ponownie wpisane. W 2007 r. Kennedy był jednym z trzech finalistów nominowanych przez Public Justice do tytułu „Prawnika Roku” za rolę, jaką odegrał w procesie o 396 milionów dolarów, w którym ława przysięgłych wydała wyrok przeciwko firmie DuPont w związku z zanieczyszczeniem środowiska w fabryce cynku w Spelter w Zachodniej Wirginii. W 2017 roku kancelaria była częścią zespołu procesowego, który zabezpieczył ugodę o wartości 670 milionów dolarów w imieniu ponad 3000 mieszkańców z Ohio i Wirginii Zachodniej, których woda pitna została skażona toksyczną substancją chemiczną, C8, która została uwolniona do środowiska przez DuPont w Parkersburgu w Wirginii Zachodniej.
Morgan & Morgan PA
W 2016 roku Kennedy został radcą prawnym w kancelarii Morgan & Morgan P.A. Partnerstwo powstało w wyniku udanej współpracy obu firm przy sprawie przeciwko SoCalGas Company po wycieku gazu w Aliso Canyon w Kalifornii. W 2017 roku Kennedy i jego partnerzy pozwali firmę Monsanto w sądzie federalnym w San Francisco, w imieniu powodów starających się o odszkodowanie za chłoniaka nieziarniczego, który, jak twierdzą powodowie, był wynikiem narażenia na herbicyd Roundup firmy Monsanto na bazie glifosatu. Kennedy i jego zespół złożyli również pozew zbiorowy przeciwko Monsanto za brak ostrzeżenia konsumentów o zagrożeniach, jakie rzekomo stwarza ekspozycja na Roundup. We wrześniu 2018 roku Kennedy i jego partnerzy złożyli pozew zbiorowy przeciwko Columbia Gas of Massachusetts, zarzucając zaniedbania po eksplozjach gazu w trzech miastach na północ od Bostonu. O Columbia Gas, Kennedy powiedział „budując nowe mile rur, ta sama firma ignoruje swoją istniejącą infrastrukturę, która, jak teraz wiemy, ulega erozji i jest zniszczona.”
Przedsiębiorczość w zakresie czystych technologii i infrastruktury energii odnawialnej
W 1998 roku Kennedy, Chris Bartle i John Hoving stworzyli firmę zajmującą się butelkowaną wodą, Keeper Springs, która przekazała wszystkie swoje zyski na rzecz Waterkeeper Alliance. W 2013 roku Kennedy i jego partner sprzedali markę firmie Nestlé w zamian za darowiznę na rzecz lokalnych Waterkeepers.
Kennedy był partnerem venture i starszym doradcą w VantagePoint Capital Partners, jednej z największych na świecie firm cleantech venture capital. VantagePoint był m.in. pierwotnym i największym inwestorem instytucjonalnym w Teslę w okresie przed IPO. VantagePoint wspierał również między innymi BrightSource Energy i Solazyme. Kennedy jest członkiem zarządu i doradcą kilku spółek portfelowych Vantage Point z branży wodnej i energetycznej, w tym Ostara, firmy z siedzibą w Vancouver, która wprowadza na rynek technologię usuwania fosforu i innych nadmiernych składników odżywczych ze ścieków, przekształcając zanieczyszczenia bezpośrednio w wysokiej jakości nawóz. Jest również starszym doradcą Starwood Energy Group i odegrał kluczową rolę w wielu inwestycjach tej firmy.
Jest w zarządzie Vionx, producenta systemów przepływowych baterii wanadowych na skalę użytkową z siedzibą w Massachusetts. 5 października 2017 r. firmy Vionx, National Grid i Departament Energii USA zakończyły instalację zaawansowanych akumulatorów przepływowych w Holy Name High School w mieście Worcester w stanie Massachusetts. Współpraca obejmuje również Siemensa oraz United Technologies Research Center i stanowi jeden z największych magazynów energii w Massachusetts.
Kennedy jest Partnerem w firmie ColorZen, która oferuje gotowe rozwiązanie do wstępnej obróbki włókien bawełnianych, które zmniejsza zużycie wody i zrzuty toksyczne w procesie barwienia bawełny.
Kennedy był współwłaścicielem i dyrektorem firmy Utility Integration Solutions (UISol) zajmującej się inteligentnymi sieciami, która została przejęta przez Alstom. Obecnie jest współwłaścicielem i dyrektorem GridBright, wiodącego na rynku specjalisty w zakresie zarządzania sieciami energetycznymi.
W październiku 2011 r. Kennedy był współzałożycielem EcoWatch, witryny informacyjnej poświęconej ochronie środowiska. Zrezygnował z członkostwa w zarządzie w styczniu 2018 r.
Społeczności mniejszościowe i ubogie
W swojej pierwszej sprawie jako adwokat ds. środowiska Kennedy reprezentował NAACP w pozwie przeciwko propozycji budowy stacji przeładunkowej śmieci w dzielnicy mniejszościowej w Ossining w Nowym Jorku.
W 1987 roku z powodzeniem pozwał hrabstwo Westchester w Nowym Jorku o ponowne otwarcie parku Croton Point, który był intensywnie wykorzystywany głównie przez biedne i mniejszościowe społeczności z Bronxu. Następnie wymusił ponowne otwarcie Pelham Bay Park w Bronksie, który Nowy Jork zamknął dla publiczności i przekształcił w policyjną strzelnicę.
Kennedy argumentował, że biedne społeczności ponoszą nieproporcjonalnie duży ciężar zanieczyszczenia środowiska. Przemawiając na konferencji środowiskowej 2016 SXSW Eco w Austin w Teksasie, powiedział: „Zanieczyszczacze zawsze wybierają miękki cel ubóstwa”, zauważając, że południowa strona Chicago ma największe stężenie wysypisk toksycznych odpadów w Ameryce. Ponadto, dodał, że 80 procent „niekontrolowanych wysypisk toksycznych odpadów” można znaleźć w czarnych dzielnicach, z największym miejscem w Stanach Zjednoczonych jest Emelle, Alabama, która jest w 90 procentach czarna.
Prawa międzynarodowe i rdzenne
Począwszy od 1985 roku, Kennedy pomagał rozwijać międzynarodowy program Rady Obrony Zasobów Naturalnych (NRDC) w zakresie ochrony środowiska, energii i praw człowieka, podróżując do Kanady i Ameryki Łacińskiej, aby pomagać rdzennym plemionom w ochronie ich ojczyzn i przeciwstawianiu się dużym projektom energetycznym i wydobywczym w odległych obszarach dzikiej przyrody.
W 1990 roku Kennedy pomagał Indianom Pehuenche w Chile w częściowo udanej kampanii mającej na celu powstrzymanie budowy serii tam na kultowej chilijskiej rzece Biobío. Kampania ta wyhamowała wszystkie z wyjątkiem jednej z proponowanych tam. Od 1992 r. pomagał Indianom Cree z północnego Quebecu w ich kampanii przeciwko Hydro-Québec, mającej na celu powstrzymanie budowy około 600 proponowanych tam na jedenastu rzekach w James Bay.
W 1993 r. Kennedy i NRDC, współpracując z organizacją Cultural Survival, walczyli z innymi amerykańskimi grupami ekologicznymi w sporze o prawa Indian do zarządzania własnymi ziemiami w regionie Oriente w Ekwadorze. Kennedy reprezentował CONFENIAE, konfederację ludów indiańskich, w negocjacjach z amerykańskim koncernem naftowym Conoco w celu ograniczenia rozwoju wydobycia ropy w ekwadorskiej Amazonii i jednocześnie uzyskania korzyści z wydobycia surowców dla plemion amazońskich. W latach 1993-1999 Kennedy współpracował z pięcioma plemionami indiańskimi z wyspy Vancouver w ich kampanii na rzecz zakończenia przemysłowego wyrębu lasów przez firmę MacMillan Bloedel w Clayoquot Sound w Kolumbii Brytyjskiej.
W 1996 roku Kennedy spotkał się z kubańskim prezydentem Fidelem Castro, aby przekonać przywódcę do wstrzymania planów budowy elektrowni atomowej w Juraguá. Podczas długiego, nocnego spotkania Castro wspominał ojca i wuja Kennedy’ego, spekulując, że stosunki USA z Kubą byłyby o wiele lepsze, gdyby prezydent Kennedy nie został zamordowany.
W latach 1996-2000 Kennedy i NRDC pomogli meksykańskim rybakom komercyjnym powstrzymać propozycję firmy Mitsubishi, by zbudować zakład solny w Laguna San Ignacio, znanym obszarze w Baja, gdzie rozmnażają się szare wieloryby i karmią swoje cielęta. Kennedy napisał obszerne pismo przeciwko temu projektowi i zabrał kampanię do Japonii, spotykając się z japońskim premierem Keizo Obuchi.
W 2000 roku pomógł lokalnym aktywistom ekologicznym powstrzymać propozycje Chaffin Light, dewelopera nieruchomości, i amerykańskiego giganta inżynieryjnego Bechtel przed budową dużego hotelu i kurortu, który, jak argumentował Kennedy, zagrażał rafom koralowym i publicznym plażom, z których często korzystają miejscowi Bahamińczycy, w Clifton Bay na wyspie New Providence. Po tym wydarzeniu, nowy rząd Bahamów wyznaczył ten obszar jako Heritage Park.
Kennedy był jednym z pierwszych redaktorów Indian Country Today, największej w Ameryce Północnej gazety dla rdzennych Amerykanów. Pomagał przewodzić opozycji wobec budowy zapory wodnej na rzece Futaleufú w regionie Patagonii w Chile. W 2016 roku, powołując się na presję wywołaną przez kampanię Futaleufú Riverkeeper przeciwko tamom, hiszpańska firma energetyczna Endesa, która posiadała prawo do spiętrzenia rzeki, cofnęła swoją decyzję i zrzekła się wszelkich roszczeń do Futaleufú.
Wojsko i Vieques
Kennedy był krytykiem niszczenia środowiska przez wojsko amerykańskie. W 1993 r. z powodzeniem reprezentował plemiona Indian Suquamish i Duwamish w procesie przeciwko amerykańskiej stoczni marynarki wojennej Puget Sound w Bremerton, w stanie Waszyngton, o zaprzestanie zanieczyszczania zatoki Puget Sound.
W artykule z 2001 r. Kennedy opisał, jak pozwał Marynarkę Wojenną USA w imieniu rybaków i mieszkańców Vieques, wyspy u wybrzeży Puerto Rico, o zaprzestanie testów broni, bombardowań i innych ćwiczeń wojskowych. Kennedy argumentował, że działania te były niepotrzebne, i że Marynarka Wojenna nielegalnie zniszczyła kilka zagrożonych gatunków, zanieczyściła wody wyspy, zaszkodziła zdrowiu mieszkańców i zniszczyła gospodarkę. Został aresztowany za wtargnięcie na teren Camp Garcia Vieques, ośrodka szkoleniowego Marynarki Wojennej USA, gdzie wraz z innymi protestował przeciwko wykorzystywaniu części wyspy do szkoleń. Kennedy odsiedział 30 dni w więzieniu o zaostrzonym rygorze w Puerto Rico. Incydent z wtargnięciem na wyspę wymusił zawieszenie ćwiczeń z ostrym ogniem na prawie trzy godziny. Pozwy i protesty Kennedy’ego, a także setek Portorykańczyków, którzy również zostali uwięzieni, w końcu wymusiły zakończenie bombardowań morskich na Vieques, ogłoszone przez prezydenta George’a Busha w 2001 r. i wprowadzone w życie w 2003 r.
W artykule z 2003 r. dla Chicago Tribune, Kennedy oskarżył rząd federalny USA o bycie „największym trucicielem Ameryki”, a Departament Obrony USA o najgorsze przewinienie. Powołując się na EPA, powiedział, że „niewypały można znaleźć na 16,000 poligonów wojskowych… a ponad połowa z nich może zawierać broń biologiczną lub chemiczną”.
Fabryczne farmy
Przez prawie dwadzieścia lat Kennedy i jego Waterkeepers prowadzili prawną i public relations bitwę przeciwko zanieczyszczeniu środowiska przez fabryczne farmy. W latach 90-tych Kennedy zwołał sprzeciw wobec ferm fabrycznych wśród drobnych, niezależnych rolników, zwołał serię „Narodowych Szczytów” na temat fabrycznych produktów mięsnych i przeprowadził konferencje prasowe w Karolinie Północnej, Iowa, Kansas, Missouri, Illinois, Ohio oraz w Waszyngtonie. Począwszy od 2000 roku, Kennedy pozwał do sądu fermy fabryczne w Karolinie Północnej, Oklahomie, Maryland i Iowa. Napisał wiele artykułów na ten temat, argumentując, że fermy fabryczne produkują gorszej jakości, mniej zdrową żywność i są szkodliwe dla niezależnych rodzinnych rolników, zatruwając im powietrze i wodę, obniżając wartość ich nieruchomości i wykorzystując rozległe subsydia stanowe i federalne do narzucania nieuczciwej konkurencji wobec mniejszych rolników.
W 1995 roku premier Alberty Ralph Klein ogłosił Kennedy’ego persona non grata w prowincji z powodu jego aktywizmu przeciwko zakładom produkcji wieprzowiny na dużą skalę w Albercie. W 2002 roku Smithfield Foods złożył pozew przeciwko Kennedy’emu w Polsce, na podstawie polskiego prawa, które czyni krytykowanie korporacji nielegalnym, po tym jak Kennedy potępił firmę w debacie z polskim dyrektorem Smithfielda przed polskim parlamentem.
Ropa, gaz i rurociągi
Kennedy był zwolennikiem globalnego odejścia od paliw kopalnych na rzecz energii odnawialnej. Jest szczególnie krytyczny wobec przemysłu naftowego. Rozpoczął swoją karierę w Riverkeeper w czasie, gdy organizacja odkryła, że Exxon używał swoich tankowców do kradzieży słodkiej wody z rzeki Hudson w celu wykorzystania jej w rafinerii na Arubie i sprzedaży Wyspom Karaibskim. Riverkeeper wygrał ugodę na 2 miliony dolarów przeciwko Exxonowi i skutecznie lobbował na rzecz stanowego prawa zakazującego tej praktyki. W jednej ze swoich pierwszych spraw związanych z ochroną środowiska Kennedy złożył pozew przeciwko Mobil Oil za zanieczyszczanie rzeki Hudson.
Kennedy pomógł poprowadzić bitwę przeciwko szczelinowaniu w stanie Nowy Jork. Był on wczesnym zwolennikiem gazu ziemnego jako realnego paliwa pomostowego do odnawialnych źródeł energii i czystszej alternatywy dla węgla. Powiedział jednak, że zwrócił się przeciwko tej kontrowersyjnej metodzie wydobycia po zbadaniu jej kosztów dla zdrowia publicznego, klimatu i infrastruktury drogowej. Jako członek komisji ds. szczelinowania przy gubernatorze Andrew Cuomo, Kennedy przyczynił się do wprowadzenia przez gubernatora w 2013 r. zakazu szczelinowania w stanie Nowy Jork.
Kennedy podjął ogólnokrajowe wysiłki przeciwko budowie zakładów produkujących skroplony gaz ziemny. Waterkeepers prowadzi krajową obserwację, która corocznie dokumentuje liczne wycieki ropy naftowej. Na Alasce Kennedy brał czynny udział w walce o ocalenie przed odwiertami Arctic National Wildlife Refuge (ANWR), największego nienaruszonego ekosystemu w Ameryce Północnej.
W 2013 roku Kennedy wspierał Chipewyan First Nation i Beaver Lake Cree walczące o ochronę swoich ziem przed wydobyciem piasków bitumicznych. W lutym 2013 roku, podczas protestu przeciwko rurociągowi Keystone XL, Kennedy wraz z synem, Conorem, został aresztowany za blokowanie drogi przelotowej przed Białym Domem podczas protestu. W sierpniu 2016 roku Kennedy i Waterkeeper brali udział w protestach mających na celu zablokowanie przedłużenia rurociągu Dakota Access przez zasoby wodne Indian Sioux w rezerwacie Standing Rock.
Kennedy twierdzi, że jedynym powodem, dla którego przemysł naftowy jest w stanie pozostać konkurencyjny wobec odnawialnych źródeł energii i samochodów elektrycznych, są masowe bezpośrednie i pośrednie dotacje oraz interwencje polityczne w imieniu przemysłu naftowego. W wywiadzie z czerwca 2017 r. na EnviroNews, Kennedy powiedział o przemyśle naftowym: „To właśnie jest ich strategia: zbudować jak najwięcej mil rurociągu, jak to tylko możliwe. A to, co przemysł stara się zrobić, to zwiększyć ten poziom inwestycji w infrastrukturę, aby nasz kraj nie był w stanie od tego odejść.
Węgiel
Pod przewodnictwem Kennedy’ego organizacja Waterkeeper rozpoczęła kampanię „Czysty węgiel to śmiertelne kłamstwo” w 2001 r., wnosząc dziesiątki pozwów sądowych wymierzonych w praktyki górnicze, które obejmują usuwanie wierzchołków gór, budowę stawów szlamowych, a także wymierzone w emisje rtęci i stosy popiołu węglowego przez spalające węgiel przedsiębiorstwa użyteczności publicznej. Sojusz Waterkeeper Kennedy’ego prowadzi również walkę z eksportem węgla, w tym z terminali w Pacific Northwest.
Kennedy promuje zastąpienie energii z węgla energią odnawialną, która, jak twierdzi, zmniejszyłaby koszty i emisję gazów cieplarnianych, poprawiając jednocześnie jakość powietrza i wody, zdrowie obywateli oraz liczbę i jakość miejsc pracy.W czerwcu 2011 r. producent filmowy Bill Haney wyemitował w telewizji swój wielokrotnie nagradzany film „The Last Mountain”, którego współautorami są Haney i Peter Rhodes, przedstawiający walkę Kennedy’ego o powstrzymanie wydobycia węgla w Appalachach.
Energia jądrowa
Kennedy był przeciwnikiem konwencjonalnej energii jądrowej, argumentując, że jest ona niebezpieczna i nie jest ekonomicznie konkurencyjna. 15 czerwca 1981 r., gdy przemawiał na wiecu antynuklearnym w Hollywood Bowl, wraz ze Stephenem Stillsem, Bonnie Raitt i Jacksonem Browne’em, zdobył międzynarodową sławę.
Jego trzydziestoletnia walka o zamknięcie elektrowni atomowej Indian Point w Nowym Jorku zakończyła się zwycięstwem w styczniu 2017 r., gdy Kennedy podpisał porozumienie z gubernatorem stanu Nowy Jork Andrew Cuomo i Entergy, operatorem elektrowni, o jej zamknięciu do 2021 r. Kennedy wystąpił w filmie dokumentalnym z 2004 roku, Indian Point: Imagining the Unimaginable, wyreżyserowanym przez jego siostrę i dokumentalistkę Rory Kennedy.
Hydro
Kennedy był zdecydowanym przeciwnikiem zapór wodnych, zwłaszcza projektów zapór, które mają wpływ na społeczności tubylcze.
W 1991 roku Kennedy pomógł poprowadzić kampanię mającą na celu zablokowanie Hydro-Québec przed budową James Bay Hydro-project, ogromnego projektu zapory w północnym Quebecu.
Jego kampanie pomogły zablokować zapory na chilijskiej rzece Biobío w 1990 roku i na rzece Futaleufú w 2016 roku. W 2002 roku zorganizował to, co ostatecznie okazało się nieudaną bitwą przeciwko budowie tamy na rzece Macal w Belize. Kennedy nazwał tamę Chalillo Dam „a boondoggle” i wniósł głośne wyzwanie prawne przeciwko Fortis Inc, kanadyjskiemu przedsiębiorstwu energetycznemu i monopolistycznemu właścicielowi Belize’s electric utility. W 2003 roku, w orzeczeniu 3-2, Rada Najwyższa Wielkiej Brytanii podtrzymała decyzję rządu Belize o zezwoleniu na budowę tamy.
W 2004 roku Kennedy spotkał się z urzędnikami prowincji i sprowadził zagraniczne media i gości politycznych do Kanady, aby zaprotestować przeciwko budowie zapór hydroelektrycznych na rzece Magpie w Quebecu. Hydro-Quebec porzucił plany budowy tamy w 2017 r.
W listopadzie 2017 r. hiszpański syndykat hydroelektryczny Endesa ogłosił decyzję o porzuceniu HydroAysen, ogromnego projektu budowy tam na dziesiątkach rzek Patagonii, któremu towarzyszyły tysiące mil dróg, linii energetycznych i innej infrastruktury. Endesa zwróciła swoje prawa do wody rządowi Chile. Chilijska prasa uznała działania Kennedy’ego i Riverkeeper za decydujący czynnik w decyzji firmy.
Cape Wind
W 2005 roku Kennedy starł się z krajowymi grupami ekologicznymi w związku ze swoim sprzeciwem wobec farmy wiatrowej u wybrzeży Cape Cod. Stając po stronie sektora rybołówstwa komercyjnego Cape Cod, Kennedy argumentował, że projekt Cape Wind w Nantucket Sound był kosztowną igraszką. Stanowisko to rozwścieczyło niektórych ekologów i przyniosło Kennedy’emu krytykę ze strony grup przemysłowych i republikanów. Kennedy argumentował w artykule opiniotwórczym w The Wall Street Journal, że „Vermont chce wyłączyć swoją elektrownię atomową i zastąpić ją czystą, zieloną energią z HydroQuébec – energią dostępną dla przedsiębiorstw użyteczności publicznej w Massachusetts – za cenę sześciu centów za kilowatogodzinę (kwh). Energia elektryczna z Cape Wind, według ostrożnych szacunków i na podstawie danych przedstawionych przez firmę w urzędzie stanu, kosztuje 25 centów za kwh.