Meharry Medical College w Nashville powstał w 1876 roku jako oddział medyczny Central Tennessee College, instytucji założonej przez Freedman’s Aid Society of the Methodist Episcopal Church. Motywacją założycielską było szkolenie aspirujących opiekunów, aby służyć nie tylko nowo uwolnionym Afroamerykanom, ale także wszystkim, którzy byli pozbawieni i potrzebowali pomocy medycznej. Założycielem i pierwszym prezesem Meharry Medical College był pochodzący z New Hampshire George Whipple Hubbard (1841-1921), były żołnierz Unii, który uzyskał dyplom lekarza na Uniwersytecie w Nashville. Jeszcze w szkole, Hubbard rozpoczął pracę budowania Meharry z siebie jako jedyny instruktor, doradca religijny, i superintendent.
Meharry dentystycznych i wydziałów farmaceutycznych zostały zorganizowane w 1886 i 1889, odpowiednio. Nie było tylko jeden członek w pierwszej klasie absolwentów w 1890 roku; posiadał stopień Master of Arts. W 1910 roku Szkoła Pielęgniarstwa Szpitala Mercy została przeniesiona do Meharry. Szpital Hubbard został zbudowany w 1912 roku. W dniu 13 października 1915 roku, Meharry Medical College otrzymał statut oddzielny od Central Tennessee College, który zmienił nazwę na Walden University w 1900 roku.
Na 1 lutego 1921 roku, John J. Mullowney, 1908 absolwent University of Pennsylvania i były członek wydziału Girard College w Filadelfii, stał się drugim prezydentem Meharry. Pod jego kierownictwem, wymagania wstępne były rygorystycznie administrowane; liczba członków wydziału wzrosła; badania i obiekty szpitalne zostały rozszerzone, zwiększając pojemność łóżka do stu; przychodnie zostały zreorganizowane według specjalności; i superintendent szpital został zatrudniony. W 1923 roku Meharry otrzymał ocenę „A”.
Z wkładem General Education Board i Rockefeller, Rosenwald, Eastman, i Carnegie fundacji, wraz z pomocą miasta Nashville i absolwentów Meharry, kolegium przeniósł się z South Nashville do jego obecnej lokalizacji w North Nashville, jedną ulicę na zachód od Fisk University, w późnych latach 20-tych. W ten sposób rozpoczął się długi, wzajemnie korzystny związek między szkołami. Początkowo niektóre budynki służyły obu instytucjom. Późniejsze neogotyckie i College-Gothic architektura budynków obu szkół będzie odzwierciedlać symbiotyczne relacje między Fisk i Meharry. W latach trzydziestych wielu aspirujących lekarzy uzyskało wykształcenie licencjackie i przedmedyczne w Fisk, a następnie ukończyło studia medyczne w Meharry.
W 1938 roku wybitny uczony Edward L. Turner objął stanowisko prezydenta. Turner zmodyfikował program nauczania w szkole medycznej, kładąc nacisk na bardziej naukowe podejście i podkreślając znaczenie właściwych procedur klinicznych. W tym czasie Meharry zaczął doświadczać trudności finansowych, które nękały instytucję przez całe lata 40. Turner zrezygnował w 1944 roku. Dr M. D. Clawson służył jako prezydent Meharry od 1945 do 1950.
Przejściowy komitet administracyjny kierował sprawami do 1952 roku, kiedy to dr Harold D. West, pierwszy czarny prezydent szkoły, rozpoczął swoją kadencję. Pod West szkoła rozpoczęła 20 milionów dolarów fund drive, zakup ziemi przylegającej do kampusu, i dodał skrzydło do szpitala. Szkoła na nowo zdefiniowała swój cel, kończąc Szkołę Pielęgniarstwa i Wydział Technologii Dentystycznych na początku lat 60-tych. Znaczące ulepszenia również zostały dokonane do programu nauczania i obiektów w szkołach medycyny i stomatologii.
Od 1966 do 1968 roku tymczasowy komitet zarządzał Meharry do byłego dziekana szkoły medycznej, Lloyd Elam, został mianowany prezydentem. Meharry następnie ustanowił szkołę absolwent oferując stopień doktora nauk podstawowych i School of Allied Health Professions w połączeniu z Tennessee State University i Fisk University. Nowe budynki dla szkół medycyny i stomatologii oraz nowy szpital zostały zbudowane w latach 70-tych. Elam zapewnił Meharry z trzynastu lat progresywnego przywództwa i kontynuował swoją służbę dla szkoły jako wybitny członek wydziału nauczania.
W marcu 1981 roku Richard Lester, przewodniczący Wydziału Radiologii Uniwersytetu Texas Science Center i członek zarządu Meharry, przyjął obowiązki tymczasowego prezydenta na jeden rok. W lipcu 1982 roku David Satcher został trzecim czarnoskórym mężczyzną, który objął stanowisko prezydenta. Satcher awansował do rangi krajowej i w 1993 roku został mianowany dyrektorem Centrum Kontroli Chorób w Atlancie. W 1997 roku prezydent Bill Clinton nominował Satchera na stanowisko chirurga generalnego Stanów Zjednoczonych; został on potwierdzony w następnym roku.
Rzeczy Meharry zostały przekazane dr Johnowi E. Maupinowi Jr, pierwszemu absolwentowi i absolwentowi Meharry’s School of Dentistry, który stał się głównym administratorem instytucji. Maupin został dziewiątym prezydentem 1 lipca 1994 roku. Jego zadaniem było nadzorowanie budowy i renowacji obiektów, łączenie odpowiednich kadr klinicznych oraz wykonanie monumentalnej pracy polegającej na solidaryzowaniu się społeczności krajowej wokół dalszej rentowności Meharry Medical College. Maupin miał również zaaranżować inaugurację połączonych obiektów 1 stycznia 1998 roku.
Meharry Medical College obejmuje Szkołę Medyczną, Szkołę Stomatologiczną, Szkołę Studiów Podyplomowych i Badań Naukowych, Szkołę Pokrewnych Zawodów Medycznych, Metropolitan General Hospital of Nashville-Davidson County, dwa ośrodki zdrowia i Harold D. West Basic Sciences Center.
Wydział Nauk Podstawowych.