Die y-Achse eines Massenspektrums stellt die Signalintensität der Ionen dar. Bei der Verwendung von Zähldetektoren wird die Intensität oft in Counts pro Sekunde (cps) gemessen. Bei der Verwendung von analoger Detektionselektronik wird die Intensität typischerweise in Volt gemessen. Bei FTICR und Orbitraps wird das Signal im Frequenzbereich (die y-Achse) auf die Leistung (~Amplitude im Quadrat) der Sinuswelle des Signals bezogen (oft reduziert auf eine Effektivleistung); die Achse wird jedoch aus vielen Gründen normalerweise nicht als solche beschriftet. Bei den meisten Formen der Massenspektrometrie stellt die vom Spektrometer gemessene Intensität des Ionenstroms die relative Häufigkeit nicht genau dar, sondern korreliert nur lose mit ihr. Daher ist es üblich, die y-Achse mit „willkürlichen Einheiten“ zu beschriften.
Y-Achse und relative HäufigkeitBearbeiten
Die Signalintensität kann von vielen Faktoren abhängen, insbesondere von der Art der zu analysierenden Moleküle und deren Ionisierung. Die Effizienz der Ionisierung variiert von Molekül zu Molekül und von Ionenquelle zu Ionenquelle. Zum Beispiel wird in Elektrospray-Quellen im Positiv-Ionen-Modus ein quaternäres Amin außergewöhnlich gut ionisiert, während ein großer hydrophober Alkohol höchstwahrscheinlich nicht gesehen wird, egal wie konzentriert. In einer EI-Quelle werden sich diese Moleküle sehr unterschiedlich verhalten. Zusätzlich kann es Faktoren geben, die die Ionenübertragung zwischen Ionisierung und Detektion unverhältnismäßig beeinflussen.
Auf der Detektionsseite gibt es viele Faktoren, die auch die Signalintensität auf nichtproportionale Weise beeinflussen können. Die Größe des Ions beeinflusst die Auftreffgeschwindigkeit und bei bestimmten Detektoren ist die Geschwindigkeit proportional zur Signalleistung. Bei anderen Detektionssystemen, wie z. B. FTICR, ist die Anzahl der Ladungen auf dem Ion wichtiger für die Signalintensität. Bei Fourier-Transformations-Ionenzyklotron-Resonanz- und Orbitrap-Massenspektrometern ist die Signalintensität (Y-Achse) mit der Amplitude des freien Induktionszerfallsignals verknüpft. Dies ist grundsätzlich eine Potenzbeziehung (Amplitude im Quadrat), wird aber oft als . Bei abklingenden Signalen ist der Effektivwert nicht gleich der mittleren Amplitude. Zusätzlich ist die Dämpfungskonstante (Abklingrate des Signals im Fid) nicht für alle Ionen gleich. Um Rückschlüsse auf die relative Intensität zu ziehen, ist ein hohes Maß an Wissen und Sorgfalt erforderlich.
Eine gängige Methode, um mehr quantitative Informationen aus einem Massenspektrum zu erhalten, ist die Erstellung einer Standardkurve, mit der die Probe verglichen wird. Dazu muss man im Voraus wissen, was quantitativ bestimmt werden soll, einen Standard zur Verfügung haben und das Experiment speziell für diesen Zweck planen. Eine fortschrittlichere Variante davon ist die Verwendung eines internen Standards, der sich sehr ähnlich wie der Analyt verhält. Dies ist oft eine isotopenmarkierte Version des Analyten. Es gibt Formen der Massenspektrometrie, wie z. B. die Beschleuniger-Massenspektrometrie, die von Grund auf quantitativ ausgelegt sind.
Spectral skewingEdit
Spectral skewing ist die Änderung der relativen Intensität von massenspektralen Peaks aufgrund der Konzentrationsänderungen des Analyten in der Ionenquelle, wenn das Massenspektrum gescannt wird. Diese Situation tritt routinemäßig auf, wenn chromatographische Komponenten in eine kontinuierliche Ionenquelle eluieren. Spektrales Skewing wird in Ionenfallen (Quadrupol (dies wurde auch in QMS beobachtet) oder magnetischen) oder Time-of-Flight (TOF) Massenanalysatoren nicht beobachtet, da potenziell alle Ionen, die im Betriebszyklus (eine Momentaufnahme in der Zeit) des Geräts gebildet werden, für die Detektion verfügbar sind.