グリコーゲンからグルコース-1-リン酸への分解の全体的な反応は以下の通りです：
glycogen(n residues) + Pi ⇌ glycogen(n-1 residues) + glucose-1-phosphate
ここで、グリコーゲンホスホリラーゼは、α結合にホスホリル基を置換することによって、末端のグルコース残基とグリコーゲンの枝を結ぶ結合を切断します。
グルコース-1-リン酸は、ホスホグルコムターゼという酵素によって、グルコース-6-リン酸（多くの場合、解糖で終わる）に変換される。
グルコース残基は、グリコーゲンの枝から、α結合で分岐しているグルコースの4残基前までリン酸化される。 グリコーゲンデブランチング酵素は、残りの4つのグルコースユニットのうち3つを別のグリコーゲンの枝の端に移す。 これにより、α分岐点が露出し、αグルコシダーゼにより加水分解され、分岐の最後のグルコース残基がグルコース分子として取り除かれ、分岐がなくなる。 これは、グリコーゲンの代謝物がグルコース-1-リン酸でない唯一のケースである。 このグルコースはその後、ヘキソキナーゼによってグルコース-6-リン酸にリン酸化される
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