Die meisten Fische im Süßwasseraquarium fühlen sich in weichem bis mäßig hartem Wasser mit einem pH-Wert zwischen 6 und 8 wohl.
Brackwasseraquarien sind ein Sonderfall und benötigen spezielle Gemeinschaftsbecken. Einige wenige Süß- und Meerwasserfische können sich zwar an Brackwasser anpassen, die meisten jedoch nicht.
Die tödlichste Chemikalie im Aquarienwasser ist Ammoniak, das aus Fischausscheidungen entsteht. Es ist wichtig, auf Ammoniak zu testen, da es eine chemische Vorstufe von Nitriten und Nitraten ist, die ebenfalls schädlich für Fische sind. Ammoniak wird aus dem Wasser durch den Stickstoffkreislauf entfernt, der im Aquarienfilter stattfindet, der einige Wochen braucht, um mit der Verarbeitung des Ammoniaks zu beginnen. Das verarbeitete Ammoniak wird in Nitrit umgewandelt, das dann zu Nitrat verarbeitet wird. Wöchentliche Wasserwechsel (25 % des Aquarienvolumens) und das Absaugen von Ablagerungen vom Boden des Aquariums können das Problem der Nitratbildung lösen, vorausgesetzt, das Becken ist nicht überfüllt.
Die Algenbildung hängt größtenteils mit der Lichtmenge und dem mineralischen Ungleichgewicht zusammen. Ein Aquarium in der Nähe eines Fensters wird wahrscheinlich mit Algen bewachsen sein. Im Aquarienhandel ist ein sogenannter „Phosphatschwamm“ erhältlich, der das Phosphat aus dem Aquarium auslaugt und den Algenwuchs reduziert. Außerdem konkurrieren Pflanzen wie Javamoos (nicht Javafarn) mit Algen um einen anderen notwendigen Pflanzennährstoff, Nitrat, und reduzieren das Algenwachstum. Java-Moos bildet auch einen Bodendecker entlang des Bodens des Aquariums.