L’axe des ordonnées d’un spectre de masse représente l’intensité du signal des ions. Lorsqu’on utilise des détecteurs de comptage, l’intensité est souvent mesurée en comptes par seconde (cps). Lorsqu’on utilise une électronique de détection analogique, l’intensité est généralement mesurée en volts. En FTICR et en Orbitraps, le signal dans le domaine des fréquences (axe des ordonnées) est lié à la puissance (~amplitude au carré) de l’onde sinusoïdale du signal (souvent réduite à une puissance efficace) ; cependant, l’axe n’est généralement pas étiqueté comme tel pour de nombreuses raisons. Dans la plupart des formes de spectrométrie de masse, l’intensité du courant ionique mesurée par le spectromètre ne représente pas précisément l’abondance relative, mais présente une corrélation approximative avec celle-ci. Par conséquent, il est courant d’étiqueter l’axe des ordonnées avec des » unités arbitraires « .
Axe des ordonnées et abondance relativeModifier
L’intensité du signal peut dépendre de nombreux facteurs, en particulier de la nature des molécules analysées et de leur mode d’ionisation. L’efficacité de l’ionisation varie d’une molécule à l’autre et d’une source d’ions à l’autre. Par exemple, dans les sources d’électrospray en mode d’ions positifs, une amine quaternaire s’ionisera exceptionnellement bien alors qu’un grand alcool hydrophobe ne sera probablement pas vu, quelle que soit sa concentration. Dans une source EI, ces molécules se comporteront très différemment. De plus, il peut y avoir des facteurs qui affectent la transmission des ions de manière disproportionnée entre l’ionisation et la détection.
Du côté de la détection, il y a de nombreux facteurs qui peuvent également affecter l’intensité du signal de manière non proportionnelle. La taille de l’ion va affecter la vitesse d’impact et avec certains détecteurs, la vitesse est proportionnelle à la sortie du signal. Dans d’autres systèmes de détection, comme la FTICR, le nombre de charges sur l’ion est plus important pour l’intensité du signal. Dans les spectromètres de masse à résonance cyclotronique ionique à transformée de Fourier et de type Orbitrap, l’intensité du signal (axe Y) est liée à l’amplitude du signal de désintégration par induction libre. Il s’agit fondamentalement d’une relation de puissance (amplitude au carré), mais elle est souvent calculée sous forme de . Pour les signaux de désintégration, la valeur efficace n’est pas égale à l’amplitude moyenne. De plus, la constante d’amortissement (taux de décroissance du signal dans le fid) n’est pas la même pour tous les ions. Pour tirer des conclusions sur l’intensité relative, il faut beaucoup de connaissances et de précautions.
Une façon courante d’obtenir plus d’informations quantitatives à partir d’un spectre de masse est de créer une courbe standard à laquelle comparer l’échantillon. Cela nécessite de savoir à l’avance ce qui doit être quantifié, d’avoir un étalon disponible et de concevoir l’expérience spécifiquement dans ce but. Une variante plus avancée de cette méthode consiste à utiliser un étalon interne qui se comporte de manière très similaire à l’analyte. Il s’agit souvent d’une version de l’analyte marquée par un isotope. Il existe des formes de spectrométrie de masse, comme la spectrométrie de masse par accélérateur, qui sont conçues de bas en haut pour être quantitatives.
Mise à jour de l’obliquité spectrale
L’obliquité spectrale est la modification de l’intensité relative des pics du spectre de masse due aux changements de concentration de l’analyte dans la source d’ions lorsque le spectre de masse est balayé. Cette situation se produit couramment lors de l’élution des composants chromatographiques dans une source d’ions continue. L’obliquité spectrale n’est pas observée dans les analyseurs de masse à piège à ions (quadripôles (cela a également été observé dans les QMS) ou magnétiques) ou à temps de vol (TOF), car potentiellement tous les ions formés dans le cycle opérationnel (un instantané dans le temps) de l’instrument sont disponibles pour la détection.