El eje y de un espectro de masas representa la intensidad de la señal de los iones. Cuando se utilizan detectores de recuento, la intensidad suele medirse en cuentas por segundo (cps). Cuando se utiliza una electrónica de detección analógica, la intensidad se suele medir en voltios. En FTICR y Orbitraps la señal en el dominio de la frecuencia (el eje y) está relacionada con la potencia (~amplitud al cuadrado) de la onda sinusoidal de la señal (a menudo reducida a una potencia rms); sin embargo, el eje no suele estar etiquetado como tal por muchas razones. En la mayoría de las formas de espectrometría de masas, la intensidad de la corriente de iones medida por el espectrómetro no representa con exactitud la abundancia relativa, sino que se correlaciona vagamente con ella. Por lo tanto, es común etiquetar el eje y con «unidades arbitrarias».
Eje Y y abundancia relativaEditar
La intensidad de la señal puede depender de muchos factores, especialmente de la naturaleza de las moléculas que se analizan y de cómo se ionizan. La eficacia de la ionización varía de una molécula a otra y de una fuente de iones a otra. Por ejemplo, en las fuentes de electrospray en modo de iones positivos, una amina cuaternaria se ionizará excepcionalmente bien, mientras que un alcohol hidrofóbico de gran tamaño probablemente no se verá por muy concentrado que esté. En una fuente EI estas moléculas se comportarán de forma muy diferente. Además, puede haber factores que afecten a la transmisión de iones de forma desproporcionada entre la ionización y la detección.
En el lado de la detección hay muchos factores que también pueden afectar a la intensidad de la señal de forma no proporcional. El tamaño del ion afectará a la velocidad de impacto y con ciertos detectores la velocidad es proporcional a la salida de la señal. En otros sistemas de detección, como el FTICR, el número de cargas del ion es más importante para la intensidad de la señal. En los espectrómetros de masas de resonancia de ciclotrón iónico por transformación de Fourier y del tipo Orbitrap, la intensidad de la señal (eje Y) está relacionada con la amplitud de la señal de decaimiento por inducción libre. Se trata fundamentalmente de una relación de potencia (amplitud al cuadrado), pero a menudo se calcula como una . Para las señales de desintegración, el valor eficaz no es igual a la amplitud media. Además, la constante de amortiguación (tasa de decaimiento de la señal en el fid) no es la misma para todos los iones. Para sacar conclusiones sobre la intensidad relativa se requiere un gran conocimiento y cuidado.
Una forma común de obtener más información cuantitativa de un espectro de masas es crear una curva estándar con la que comparar la muestra. Esto requiere saber lo que se va a cuantificar de antemano, tener un estándar disponible y diseñar el experimento específicamente para este propósito. Una variante más avanzada es el uso de un estándar interno que se comporta de forma muy similar al analito. A menudo se trata de una versión del analito marcada isotópicamente. Hay formas de espectrometría de masas, como la espectrometría de masas con acelerador, que están diseñadas desde la base para ser cuantitativas.
Desviación espectralEditar
La desviación espectral es el cambio en la intensidad relativa de los picos del espectro de masas debido a los cambios en la concentración del analito en la fuente de iones a medida que se explora el espectro de masas. Esta situación se produce de forma rutinaria cuando los componentes cromatográficos eluyen en una fuente de iones continua. El sesgo espectral no se observa en los analizadores de masas de trampa de iones (cuadrupolo (también se ha visto en QMS) o magnéticos) o de tiempo de vuelo (TOF) porque potencialmente todos los iones formados en el ciclo operativo (una instantánea en el tiempo) del instrumento están disponibles para su detección.